重庆医科大学附属第二医院感染病科、重庆医科大学病毒性肝炎研究所、教育部感染性疾病分子生物学重点实验室胡鹏教授团队在贫困所致传染病杂志Infectious Disease of Poverty (IF=8.1)以Original Article 形式在线发表了关于中国大陆不同区域丙型肝炎病毒基因型的分子流行病学及系统发育分析的研究结果。

这是一项多中心的回顾性研究，纳入了来自中国29个省、市及自治区的丙型肝炎病毒（HCV）感染患者共11008例。对HCV基因型在不同区域、不同省、市及自治区、不同人群中的分布进行分析，并在分子流行病学层面上对HCV的基因型分布及系统发育进化进行了分析。

研究结果表明，共有HCV基因1型、2型、3型和6型4种基因型，包括14个基因亚型。HCV基因1型比例最高，占49.2%，其次是基因2型、3型和6型，分别占22.4%、16.4%和11.9%。此外，排在前五位的基因亚型分别为1b、2a、3b、6a和3a。和之前的数据相比，基因1型和2型的比例下降，而基因3型和6型的比例上升（P < 0.001）。基因3型和6型集中在30至50岁的患者中。男性患者中1b和2a亚型的比例低于女性患者（P < 0.01）。基因3型和6型在中国大陆的南部地区更为流行。1b和2a亚型的全国性传播与中国大陆北部地区的序列相关，而3a、3b和6a亚型的全国性传播与中国大陆南部地区的序列有关。

  总而言之，HCV基因亚型1b和2a仍然是中国大陆最常见的亚型，其比例在过去几年中有所下降，而基因3型和6型的比例有所上升。我们的调研究提供了中国大陆HCV病毒流行株的流行病学图谱，有助于HCV感染的预防、诊断和治疗。

图１：HCV基因亚型在全国的分布情况（ａ）以及和之前的数据的比较（ｂ）。

图２：HCV基因亚型在中国不同区域（ａ）及不同省／市／自治区（ｂ）的分布情况。

图３：通过NS5B部分序列构建最大似然树。图a-e分别显示了HCV 1b、2a、3a、3b和6a亚型的系统发生分析结果。不同颜色代表不同的地理区域。华南地区：浅蓝色，西南地区：正红色，西北地区：紫色；华北地区：深蓝色，华东地区：绿色，东北地区：黄色，华中地区：粉红色。

第一作者简介：

  唐巧，专业型博士研究生，主要研究方向是慢性丙型病毒性肝炎的预防和治疗以及和慢性乙型病毒性肝炎孕妇的免疫和病毒进化。以第一或共同第一发表SCI论文2篇。相关研究成果分别在2022年AASLD和2023年EASL上做壁报展示。