研究所实验室面积6746平方米，拥有激光共聚焦显微镜、蛋白质相互作用阵列检测系统、数字PCR仪、全自动生化分析仪、流式细胞仪分选仪、全自动核酸工作站、正置荧光显微镜、多功能病理成像扫描分析系统、细胞能量代谢检测仪、长时间动态细胞观察及功能分析系统等大型精密仪器设备，总价值5000余万元，具有开展从基础到临床的科学研究，已建成7个重要的研究平台。
1.临床医学转化平台
在十一五、十二五、十三五国家传染病科技重大专项的支持下，建设以临床为核心、科研促临床的感染病学临床医学转化研究中心。以病毒性肝炎免疫发病机制、临床转归、治疗新策略为导向，以丰富的临床资源为研究对象，对已发现的预警预测指标进行临床多中心验证和评价，定期动态随访研究队列的患者，观察其临床转归，分析临床干预措施对慢乙肝临床转归的影响，探索新的治疗策略。平台包括：ROCHE cobas 6000免疫荧光定量分析仪，中国乙肝随访与临床科研平台（China Registry of Hepatitis B，简称 CR-HepB），病毒性肝炎生物样本库，含长期研究队列、临床资料库、生物样本。
平台联系人：胡鹏 hp_cq@163.com
2.免疫学研究平台
该平台运用流式细胞术进行细胞表面标志、细胞内抗原物质、细胞受体、免疫细胞功能的分析以及细胞分选，对细胞进行免疫荧光检测、细胞内离子定量等。广泛应用在病毒性肝炎临床免疫学研究、AIDS病的检测、肿瘤的诊断及预后判断。平台现拥有1台BD FACSAria III、1台BD FACSCantoⅡ流式细胞仪、1台Beckman Coulter CytoFLEX三激光13色流式细胞仪。
平台联系人：陈敏 chenggming@qq.com 张文露 zhangwenlu@cqmu.edu.cn
3.细胞生物学平台
细胞生物学是以细胞为研究对象，从细胞的整体水平、亚显微水平、分子水平等三个层次，动态地研究细胞和细胞器的结构和功能。重点研究肝炎病毒生物学特性，病毒所致肝细胞肝癌的作用机制。该平台拥有Nikon A1 Confocal Microscope共聚焦成像系统、美国 ESSEN公司/IncuCyte ZOOM长时间动态细胞观察及功能分析系统、Covairs公司/M220基因组剪切仪等大型仪器设备。用于肿瘤研究、新药开发信号传递、多分子复合物的结构和组装、分子识别、大分子结构与功能关系分析，酶反应等多项研究工作。
平台联系人：孙航 sunhangwu@aliyun.com
4.细胞代谢组学研究平台
细胞代谢组学指着重研究单个细胞或细胞类型中所有小分子成分和波动规律，可反映和评价健康和病理机体之间的生化差异，尤其是细胞能量代谢研究被广泛应用于药物筛选、药物转化、药理毒理、细胞生理、糖尿病、肥胖症、干细胞、肿瘤等热门研究领域，在评估各种疾病与能量代谢及线粒体运作状态的相互关系以及研究能量代谢生理效应等应用中发挥越来越重要和不可替代的作用。该平台拥有美国Seahorse公司/Seahorse XFp细胞能量代谢检测仪，BioRad PROTEON XPR36蛋白质相互作用阵列检测系统等高端仪器，可进行细胞代谢分析、氧呼吸测定、药物代谢分析、线粒体有氧代谢和糖酵解等功能的分析，也可进行抗体的特征和研发、大分子和小分子药品研发、蛋白-蛋白相互作用分析和蛋白质结构和折叠的分析。
平台联系人： 廖勇 y8982000@yahoo.com 杨萍 yp_apple@yeah.net
5.生物信息学平台
该平台拥有Agilent 2200 TapeStation System全自动电泳系统，可对DNA、RNA、蛋白质进行高通量微量分析和质量控制，与新一代测序(NGS)完美结合，测序数据经高通量数据分析平台（IBM服务器）处理后，可完成体细胞突变的识别、体细胞突变模式的分析、RNA editing事件的识别、CHIP-seq以及RNA-seq等研究。
平台联系人：沈伟 shenwei356@gmail.com
新建生物样本库标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本（包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本（DNA、RNA、蛋白等）以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。平台拥有低温冰箱系统（-80℃，-40℃，20℃）、气相液氮管及补充罐系统、自动化核酸提取仪、样本库管理软件，配备分子诊断实验室和病理诊断实验室。库容量100万份标本，主要采集和分装储存的标本为“十三五”传染病学国家科技重大专项、医院重点临床专科重大项目做支撑，保证转化医学研究的需要。
平台联系人：黄慧哲 huangh1979@qq.com
7.模式动物平台
拥有HBV转基因动物、脂代谢模式动物等，能够进行与HBV感染和代谢性疾病相关的分子机制与药物筛选。
平台联系人：陈压西 chenyaxi@cqmu.edu.cn 殷文伟 ustcyww@163.com