重庆医科大学内科学（传染病）历史悠久，于1956年由上海医科大学传染病教研室分迁来渝组建，在我国老一代著名传染病学专家钱悳教授、刘约翰教授、张定凤教授、王其南教授带领下开展传染病的防治和研究工作，经数代人半个多世纪的努力，已发展成为传染病领域内国家临床医疗、科学研究和人才培养的核心基地之一，学科综合实力在西部地区处于领先地位，在国内有重要影响力，在国际上有一定的知名度。

目前本学科以重庆医科大学附属第二医院感染病科为主要临床基地，拥有150余名具有丰富临床和科研经验的医、教、研、护中青年骨干（教授和副教授40余名）。1983年被批准为首批国家药品临床研究基地，2006年、2010年两次获得SFDA药物临床试验资格认定，1989年被批准为首批国家级重点学科， 2013年获国家临床重点专科，2016年获重庆市首批临床医学转化中心。开放病床200余张，年均门诊量50000人次，出院人数每年5000人次。年出院患者中危重症患者比例超过45%，治愈好转率超过95%。主要收治病种包括各型病毒性肝炎、自身免疫性肝病、肝硬化、肝细胞癌等肝脏疾病；败血症、感染性腹膜炎、感染性腹泻、肺炎、不明原因发热等感染性疾病等。其中特色和重点技术主要为人工肝治疗技术、腹水超滤浓缩回输术、骨髓间充质干细胞移植术、TIPS术。

通过“国家特色重点学科”、“国家临床重点专科”建设项目、“重庆市肝病诊疗中心”、“重庆市临床医学转化中心”等多个项目的建设及运行，在感染病学科方向上继续以病毒性肝炎的基础与临床研究为重点，并开展病原微生物的致病与耐药机制研究、寄生虫病研究。“十一五”期间主持并完成了国家传染病科技重大专项课题“慢性乙型肝炎临床转归及相关影响因素的研究”，建立了以医院病人为基础、前瞻性、大样本的研究队列，全面系统研究了我国慢性乙型肝炎病毒感染者的临床转归及其影响因素，获得了慢性乙型肝炎病毒感染者临床转归的基础数据，凝炼与临床转归相关的病毒学、免疫学、遗传学等关键性指标，建立了对慢性乙型肝炎病毒感染临床转归的综合评估体系和多因素预测模型，预测疾病进展风险，用于指导临床实践，为制定合理的抗病毒治疗策略及方案提供科学依据。

“十二五”期间主持并完成国家传染病科技重大专项课题“慢性乙型病毒性肝炎转归预警预测的研究” ，New Switch 研究证实对于接受NUCs治疗实现病毒学应答且HBeAg清除者换用PEG-IFN治疗可实现较高HBsAg清除率，将慢性乙肝患者的HBsAg清除率从1-3%提高到16.2%(部分优势患者达33.1%），取得了突破性进展，对慢性乙型肝炎的治疗提出了“临床治愈”的全新概念，得到了全世界的高度关注，并写入了2015年最新版《中国慢性乙型肝炎防治指南》。

目前我校传染病重点学科是全国6家传染病重点学科之一，充分利用现有基础及优势，建设“以临床为中心、科研促临床、重视转化、加强推广”的特色鲜明的感染病临床医学研究中心，争取早日建设成为国家级临床医学研究中心。